Resultando de la destrucción inmensa de hábitats naturales la avifauna residente y especialmente la avifauna endémica con distribuciones muy restringidas esta amenazada gravemente.

Las especies están categorizadas siguiendo las Listas Rojas Internacional 2000 (BirdLife International 2000) y Nacional 2002 (Renjifo et al. 2002: Libro Rojo de Aves de Colombia). En total 22 especies están incluidas en categorías de amenaza de la Lista Roja Nacional y 18 especies en la Lista Roja Internacional. Información detallada de las especies amenazadas se encuentra en el Libro Rojo de Aves de Colombia (Renjifo et al. 2002), donde esta incluido información recolectado por los estudios en la eco-región Sierra Nevada de Santa Marta.